本书主要内容结构上也发生了一些变化：在保留原有“细菌学实验”“病毒学实验”以及“其他病原微生物实验”三大结构板块的同时，增加了“设计性实验”这一新的板块。原有三大板块主要由“微生物学基本技术及实验”以及“常见病原体的分离鉴定”2类实验组成，让学生牢固掌握微生物学研究的基本方法、实验技术与操作技能，加深学生对微生物学基本理论的理解与认识；“设计性实验”板块为提高学生观察、思考、分析和解决问题的能力而设计，该板块中的“思考题”可启发学生围绕实验内容展开思考。