本书共二卷，卷上共载论文五十篇，主要论述温疫病之病因、病机、证候、治疗、变证、宜忌，以及瘟疫与伤寒的区别；卷下载论文三十余篇，重点叙述瘟疫的种类、传变、治疗原则，各种兼证、变证的治疗和调理，分析前人对瘟疫认识的错误及原因，并对代表性的错误观点进行了分析批判。

上卷
原病
温疫初起
传变不常
急证急攻
表里分传
热邪散漫
内壅不汗
下后脉浮
下后脉复沉
邪气复聚
下后身反热
下后脉反数
因证数攻