王巨新编著的《清代中缅关系》的研究思路为：系统全面地论述清代中缅关系历史发展变化，在深入考察两国政治交往的同时，也讨论两国政治交往影响下的经贸关系、文化交流与人员往来；在论述两国中央层面交往的同时，也注意分析两国地方层面的往来及边境事务交涉；在研究缅甸贡期、贡道、贡物及清朝赐予、敕封等朝贡制度本身的同时，也注意对制度实际运行的探讨，以期廓清清代中缅关系的发展流变和性质特征，并对清代中缅关系研究中的历史疑问做出分析解答。

关于清代中缅关系，除有上述研究不足外，还有许多历史疑问。如乾隆朝中缅之役为什么会爆发？作为中缅之役结束标志的《老官屯协议》是怎样签订的？协议具体内容是什么？战争结束后中缅两国为何会陷入长时间的“冷战”？乾隆末年以后中缅政治关系到底是何性质？中缅双方有多少次派遣使节或代表团互访？清末中英关于缅甸界务、商务等问题是如何谈判的？中英两国又是如何勘划滇缅边界的？清代中缅两国的经贸往来、文化交流以及缅甸华侨华人情况如何？清代中缅关系对中国西南边疆历史、疆域、民族等有哪些影响？对于缅甸以至东南亚、南亚地缘政治与经济又有哪些影响？这些都是中缅关系史中值得深入探讨的重大问题。王巨新编著的《清代中缅关系》的研究，希望能对以上研究不足及历史疑问做出补充和解答。