本书分为志例、星野、形胜、梵刹、建置、灵异、赞颂、法统、释系、颁赐、古迹、流寓、精蓝、法产、方物、事略、艺文等门类；雍正《南海普陀山志》由朱谨、陈璿1704年所编纂，分为志例、星野、形胜、梵刹、建置、缘起、名号、灵感、示现、经证、法统、禅德、朝典、颁赐、古迹、流寓、精蓝、方物、法产、事略、艺文等门类。