本书是其研究《尚书》之重要专著。段玉裁以音韵训诂、小学为基本方法，立足于古文、今文相异，认为古文所遭厄运最多，遂根据伏生以下欧阳氏、夏侯氏、司马迁、董仲舒、王褒、刘向等人之今文系统，自孔安国以下刘歆、卫宏、贾逵、马融、郑康成、许慎等人之古文系统，将今文《尚书》二十八篇析为三十一篇(《盘庚》分上中下；又析出《康王之诰》)，加上《书序》，篇各一卷；以句为条目，共分一千一百五十八条，钩考异同，略于经义，详于文字，厘清《尚书》流传之脉络。