全书分上下卷，卷前有《易余小引》《三子记》两篇，卷上收文二十一篇，卷下收文十三篇，卷后有《附录》。全书总计十万余字。《易余》的语言别具风格，文中多含典故，引典涉及自先秦至明末的思想家及相关作品，及名士掌故、天文舆地、礼乐术数、文字医药等。《易余》向来被看作是方以智继承其家传易学的作品。与单纯谈易理的著作不同，方以智在书中围绕“公因反因”“一其体用”展开了一系列论述，“公因反因”被方家人视为方家易学体系的纲宗。《易余》也是一部应时救世之作，方以智在《易余》中一方面展开反省和批判，一方面在努力寻求救弊之法，渗透着强烈的忧患意识和济世精神。