本书共四篇，分别是：第一章编制说明、第二章图例、第三章河川谱系、第四章名词解释。第三章河川谱系篇是本专著的核心内容，详细描述了新疆整体水系情况，重点反映新疆四级集水分区(汇水面积3000平方千米以上)和部分五级集水分区水系分布内容，系统展示新疆水系空间图谱平台建设成果，涵盖流域形态和集水主干、支流的分布。