本版教材仍沿用上一版的基本框架，以绪论、细菌篇、病毒篇、真菌篇及附录的顺序进行编排，传承了“三菌、四体、一病毒”的医学微生物学教学体系。书中设置了相关知识点的拓展链接，重点阐述新进展以及与知识点有关的理论和实践，便于学生更加深入理解知识点和课堂重点内容；在每章后面设置了课后小结、思考题、推荐文献阅读，引导和促进学生自学，采用纸质版教材与数字资源相结合的形式呈现。