本书分为总论和分论两篇。总论包括九个模块，分别介绍刑事法一体化概论、犯罪成立与刑事证明、量刑及其证明、刑事案件事实认定与法律适用、强制措施的运用与证明、不起诉刑事案件的实体与程序问题、移送审查起诉刑事案件的事实与法律适用、提起公诉刑事案件的事实与证明和刑事案件中的证明责任分配。其中，第一个模块重点介绍刑事法一体化的理论与实现路径，第二至四个模块重在刑事实体法与刑事证据法之间的关系的探讨；第五至九个模块则围绕刑事诉讼制度中涉及的刑事实体法与刑事证据法知识综合运用问题进行介绍。分论就单位刑事案件、不作为刑事案件、刑民交叉刑事案件、行刑交叉刑事案件、侵犯人身刑事案件、侵犯财产刑事案件等的程序与证据问题进行专题介绍。