全书分为学术思想、临证经验、医案举隅、医话集萃和师生论文拔萃等五个主要部分。在学术思想部分，吴教授提出了和合论思想及其在中医学中的应用，复杂性思维诊疗模式等创新观点。临证经验部分则详细记录了吴教授在诊治胃肠动力病、功能性胃肠病等方面的独特方法和经验。医案举隅收录了吴教授在内科、外科、妇科、儿科等多个领域的典型医案，展现了其临床实践的丰富性和多样性。