本书卷一、卷二为论集、平脉法 ; 卷三为伤寒例、杂病例 ; 卷四为湿病脉证并治篇 ; 卷五为伤暑、热病、湿病、伤燥、伤风、寒病脉证并治篇 ; 卷六至卷八为太阳病篇 ; 卷九至卷十一为阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴篇 ; 卷十二为霍乱吐利病、痉、阴阳易、差后劳复病篇 ; 卷十三为百合孤惑阴阳毒病、疟病、血痹虚劳病篇 ; 卷十四为咳嗽水饮黄汗历节病篇 ; 卷十五为瘀血吐衄下血疮痈病篇 ; 卷十六为妇人病篇 ; 卷末为杂疗方、禽兽鱼虫禁忌并治、果实菜谷禁忌并治。