世界联军在X探险特工队队员小尚的带领下，阻击产生异变的恐龙群。与此同时，X探险特工队正在追击小恐龙人，艾美丽发明的机械兽甲也加入了战斗。但是，小恐龙人的实力太强，大家不是他的对手。这时，达文西博士带来的核能黑洞丸帮了大忙，变异的恐龙和小恐龙人都被吸入时空裂口。就在小宇即将被吸入时空裂口时，大勇及时赶到，将他拉了回来。地球恢复了平静，大家也意识到团结和友情的力量。