本书系统探讨了微生物群落组装的生态过程及其对生态系统功能的影响，结合多项野外与室内实验，深入分析了扩散限制、中性过程、选择机制、历史过程等对微生物多样性的作用机制。此外，本书还关注了土壤病毒的生态功能及其对全球变化的响应。

更多科学出版社服务，请扫码获取。

2006-09至2010-07, 运城学院, 生物科学, 学士； 2010-09至2015-06, 北京师范大学, 生态学，博士，导师: 张大勇。1. 2018-01至现在, 山西师范大学, 生命科学学院, 副教授 2. 2018-07至2019-07, 英国埃克塞特大学, 生物科学系, 访问学者 3. 2015-07至2017-12, 山西师范大学, 生命科学学院, 讲师专业：生态学；研究方向：微生物生态学无

目录
第1章 绪论 1
1.1 微生物群落组装的生态过程 1
1.1.1 群落组装的4 个基本过程及其在微生物群落中的重要性 1
1.1.2 选择、漂变、成种和扩散的相互作用对微生物群落组装的影响 4
1.1.3 微生物群落组装的时间和空间尺度 4
1.1.4 微生物群落组装过程对生态系统功能的影响 5
1.2 土壤微生物的生态系统功能及研究途径 6
1.2.1 土壤微生物功能的重要性 6
1.2.2 微生物多样性和生态系统功能间的关系 6
1.2.3 微生物多样性对生态系统功能作用机制的假说 7
1.2.4 土壤微生物群落整体操纵的实验途径 8
1.3 环境变化对土壤微生物多样性与生态功能的影响 11
1.4 土壤病毒的生态功能及对环境变化的响应值得关注 13
参考文献 14
第2章 扩散限制对微生物群落构建的影响 19
2.1 土壤采集和繁殖体添加实验 19
2.2 土壤DNA提取和细菌高通量焦磷酸平行测序 21
2.2.1 土壤DNA提取 21
2.2.2 细菌群落结构的焦磷酸测序分析 22
2.3 繁殖体添加对局域土壤细菌群落的影响 23
2.4 繁殖体添加实验方法在微生物生态学中的应用 27
2.5 扩散过程和群落组装的联系 29
2.6 总结 30
参考文献 30
第3章 土壤细菌群落的物种续存和群落生产力模式对扰动的响应 33
3.1 中性过程在草原土壤细菌群落组装中的重要性 33
3.2 土壤微宇宙扰动实验 34
3.3 土壤细菌高通量焦磷酸平行测序 36
3.4 土壤细菌DNA 总量的确定 36
3.5 扰动降低土壤细菌群落多样性 37
3.6 土壤细菌物种存活概率对扰动的响应 39
3.7 土壤细菌群落生物量对扰动的响应 44
3.8 总结 44
参考文献 45
第4章 土壤微生物多样性和水分对土壤异养呼吸的影响 53
4.1 土壤采集和处理 53
4.2 实验装置和土壤呼吸测量 55
4.3 土壤微生物多样性和水分处理下的土壤呼吸值 56
4.4 随着时间推移土壤呼吸速率的变化 59
4.5 生物多样性限制土壤异养呼吸并减缓呼吸对水分增加的响应 59
4.6 总结 63
参考文献 63
第5章 土壤病毒和细菌多度对环境因子变化的响应 66
5.1 内蒙古多伦全球变化多因子实验 66
5.2 土壤病毒和细菌提取 67
5.3 土壤病毒和细菌计数与分析 67
5.4 不同环境因子对草原土壤病毒、细菌多度及病毒-细菌多度比的影响 69
5.5 总结 74
参考文献 75
第6章 微生物迁入降低群落构建过程中选择的作用 77
6.1 实验所用水体的选择 77
6.1.1 研究区概况 77
6.1.2 水样采集和理化性质分析 78
6.1.3 水体微生物DNA 提取及细菌Illumina MiSeq高通量测序 79
6.1.4 水体细菌物种组成 80
6.1.5 样本复杂度分析（α多样性） 83
6.1.6 水体细菌群落β多样性 87
6.1.7 小结 88
6.2 新群落构建实验 88
6.2.1 区域物种库的收集 88
6.2.2 水样的采集 89
6.2.3 新群落构建的微宇宙实验设计 89
6.3 水体微生物群落多样性和物种组成 91
6.3.1 细菌群落的测序分析 91
6.3.2 微生物群落的α 多样性 93
6.3.3 微生物群落的β 多样性 94
6.3.4 微生物群落组成 97
6.4 微生物群落在早期不存在扩散限制，后期出现扩散淹没 98
6.5 微生物迁入降低选择的作用 100
6.6 总结 103
参考文献 103
第7章 历史过程在微生物群落构建中的作用 107
7.1 交互移植微宇宙实验 107
7.1.1 区域物种库的收集 107
7.1.2 水样的采集 107
7.1.3 交互移植微宇宙实验设计 107
7.1.4 细菌群落的测序分析 111
7.2 历史过程在微生物群落构建中的作用 111
参考文献 118
第8章 环境选择在水体微生物群落构建中的作用 119
8.1 我国及临汾地区水资源现状 119
8.1.1 我国水资源现状 119
8.1.2 临汾地区水资源现状 120
8.2 水体理化性质四季变化 120
8.2.1 采样点的设置 120
8.2.2 水样的采集 121
8.2.3 水体理化参数的测定 121
8.3 基本理化性质四季变化 121
8.3.1 水体温度和pH四季变化 121
8.3.2 水体DO四季变化 123
8.3.3 水体CODCr四季变化 124
8.3.4 水体TP四季变化 125
8.3.5 水体TN 四季变化 126
8.3.6 水体NH3-N四季变化 127
8.3.7 小结 128
8.4 水体微生物DNA提取及Illumina高通量测序 128
8.5 环境因子在水体细菌群落构建中的作用 130
8.5.1 不同季节不同水域细菌群落组成差异 130
8.5.2 不同季节不同水域细菌α 多样性分析 132
8.5.3 不同季节不同水域细菌β 多样性分析 137
8.5.4 环境因子在细菌群落构建中的选择作用 139
8.6 环境因子在水体真核微生物群落构建中的作用 143
8.6.1 不同季节不同水域真核微生物群落组成差异 143
8.6.2 不同季节不同水域真核微生物α 多样性分析 145
8.6.3 不同季节不同水域真核微生物β 多样性分析 149
8.6.4 环境因子在真核微生物群落构建中的选择作用 151
8.7 总结 156
参考文献 157