本书子部共分十二类，其中：儒家类二十六种，道家类三种，兵家类三种，农家类十三种，医家类二十二种，术数类一种，艺术类三十五种，谱录类十九种，杂家类六十七种，道教类一种，释家类二种，新学类一种，总计一百九十三种。从分类及数据中可总结出《嘉兴文献丛书》子部的两大特征：一是成果全面，几乎遍及子部各类，“百科式”地呈现出嘉兴地区丰富的思想、知识、技术和文化成就；二是儒家、农家、医家、艺术、谱录与杂家等六类的著述成就尤其突出，在一定程度上折射出嘉兴地区学者、文人的学术趣味。