《GraphPad Prism统计分析与科技绘图》结合52个典型案例,全面、系统地介绍GraphPad Prism统计分析与科技绘图的核心知识。本书遵循手把手教学的特点,从入门知识讲起,逐步深入介绍统计分析和图形绘制,并重点介绍统计指标结果解读和图形元素的修饰与美化等。《GraphPad Prism统计分析与科技绘图》特意提供11小时配套教学视频,帮助读者高效、直观地学习。
《GraphPad Prism统计分析与科技绘图》共9章。第1章GraphPad Prism概述,简要介绍GraphPad Prism的知识框架;第2章均数比较,详细介绍组间连续型变量的比较;第3章相关性分析与线性回归,详细介绍两个连续型变量间线性关系的分析;第4章卡方检验,详细介绍两个分类变量间关系的分析;第5章ROC曲线绘制与分析,详细介绍单变量与两变量ROC曲线的绘制与分析;第6章Kaplan-Meier曲线及其生存分析,详细介绍Kaplan-Meier曲线的常用术语与生存分析;第7章非线性回归,详细介绍两个连续型变量间非线性关系的分析;第8章图形绘制实战,结合典型案例详细介绍28种图形及其变种图形的绘制;第9章多因素回归分析,详细介绍4种多因素回归分析方法。
《GraphPad Prism统计分析与科技绘图》内容丰富,讲解通俗易懂,案例典型,实用性强,适合GraphPad Prism入门与进阶读者阅读,也适合高校与科研机构的研究人员、企事业单位负责数据报表的相关人员阅读,还适合作为相关高等院校和培训机构的教材。
结合52个典型案例,详解统计分析与科技绘图的核心知识;
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本书特色:
视频教学:赠送11小时配套教学视频,帮助读者高效、直观地学习重点和难点内容,从而取得更好的学习效果。
内容新颖:书中的所有绘图案例均采用官方新发布的GraphPad Prism 9.5.0版进行讲解,以保证读者所学知识符合技术发展趋势。
内容丰富:不但详细介绍均数比较、相关性分析、线性回归、卡方检验、ROC曲线分析、Kaplan-Meier曲线生存分析、非线性回归、多因素回归等统计分析的核心知识,而且结合典型案例详细介绍28种图形及其变种图形的绘制。
门槛很低:从数据录入开始讲解,逐步深入讲解统计分析的核心知识点和GraphPad Prism科技绘图的方法,真正做到手把手教学,非常适合零基础读者学习。
案例丰富:结合52个典型应用案例讲解核心知识点,每个核心知识点基本都有对应的案例,而且同一案例给出多种图形绘制方法,有很强的实用性。
经验总结:全面归纳和整理笔者10余年的GraphPad Prism使用心得与教学经验,帮助读者绕开学习中的弯路,从而更加顺利地学习。
配套资源获取方式:
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GraphPad Prism是常用的数据分析和科技绘图软件,它具有功能强大、图表丰富、绘图方法多样、易学易用等特点,在人文社科、农林医药等科研和教育领域有广泛的应用。对于在读研究生和从事科学研究的在职人员等群体而言,GraphPad Prism是做科研快人一步的利器,也是在SCI(Science Citation Index)上发表论文超越同行不可或缺的神器,更是完成科研任务和超越同行必不可少的重器,一直颇受该类群体的广泛好评。
GraphPad Prism操作界面简洁明了,易于理解,即便你是一个毫无统计学背景的小白用户也能快速上手。GraphPad Prism具有丰富的用户引导界面、官方操作示例、帮助文档、内置图形模板和预设样式等,可以手把手地引导小白用户完成数据的录入、统计分析和图表制作等操作,从而降低学习成本和使用门槛。
GraphPad Prism集成众多图形,包括但不限于折线图、散点图、柱状图、饼图、气泡图、森林图、ROC曲线、生存曲线、剂量-反应曲线、生长曲线等,可以充分满足用户对教学和科研工作的可视化需求。GraphPad Prism图形为易于拆解的矢量图形,因此无论是初学者还是进阶者都可以针对图形的各种元素(如颜色、字体、坐标轴、标题、刻度、辅助线、网格线、背景类型等)进行个性化方案订制,以满足用户在不同场景展示工作成果的需求。
GraphPad Prism内置了多种统计分析模型,可以充分满足不同学科的统计需求,无论是人文社科领域的研究者还是农林医药领域的研究者,均可利用GraphPad Prism完成常规的数据统计工作。例如:可以计算均值、中位数、标准差、四分位数等,用于描述数据的基本特征;还可以进行t检验、卡方检验、方差分析、非参数秩和检验等,用于比较组间差异;还可进行相关性分析、线性分析、非线性分析、主成分分析、生存分析、多因素分析等,用于分析变量间的关系。
近年来,随着GraphPad Prism软件的不断更新和迭代,一些新方法、新图表不断加入GraphPad Prism资源库中,这使得该软件的功能更加强大。为了帮助统计分析和数据可视化等领域的相关科研人员和职场从业人员学习和掌握该软件,笔者编写了本书。相信通过阅读本书,读者可以在较短的时间内掌握GraphPad Prism统计分析和科技绘图的相关知识,从而解决统计工作中的各种问题。
本书特色
视频教学:赠送 11 小时配套教学视频,帮助读者高效、直观地学习重点和难点内容,从而取得更好的学习效果。
内容新颖:书中的所有绘图案例均采用官方新发布的GraphPad Prism 9.5.0版进行讲解,以保证读者所学知识符合技术发展趋势。
内容丰富:不但详细介绍均数比较、相关性分析、线性回归、卡方检验、ROC曲线分析、Kaplan-Meier曲线生存分析、非线性回归、多因素回归等统计分析的核心知识,而且结合典型案例详细介绍28种图形及其变种图形的绘制。
门槛很低:从数据录入开始讲解,逐步深入讲解统计分析的核心知识点和GraphPad Prism科技绘图的方法,真正做到手把手教学,非常适合零基础读者学习。
案例丰富:结合 52 个典型应用案例讲解核心知识点,每个核心知识点基本都有对应的案例,而且同一案例给出多种图形绘制方法,有很强的实用性。
经验总结:全面归纳和整理笔者10余年的GraphPad Prism实操心得与教学经验,帮助读者绕开学习中的各种弯路,从而更加顺利地学习。
本书内容
本书分为9章,各章内容简要介绍如下:
第1章GraphPad Prism概述,详细介绍GraphPad Prism的基本知识框架和注意事项等。
第2章均数比较,详细介绍组间连续型变量的比较方法与图形绘制。其中:比较方法涉及两独立样本t检验、配对t检验、单因素方差分析、单因素重复测量方差分析、双因素方差分析、双因素重复测量方差分析、三因素方差分析等;图形绘制涉及柱状图、连线图、折线图、箱式图、小提琴图、散点图的绘制等。
第3章相关性分析与线性回归,详细介绍两个连续型变量间线性关系的分析方法与图形绘制。其中:分析方法涉及相关性检验、回归分析、分层分析等;图形绘制涉及散点图和拟合直线的绘制等。
第4章卡方检验,详细介绍两个分类变量间关系的分析方法及图形绘制。其中:分析方法涉及列联表卡方检验、灵敏度计算、特异度计算等;图形绘制涉及柱状图绘制等。
第5章ROC曲线绘制与分析,详细介绍单变量ROC曲线和两变量ROC曲线的分析方法与图形绘制。其中:分析方法涉及ROC曲线下的面积、灵敏度、特异度、约登指数等指标的计算等;图形绘制涉及单条ROC曲线和多条ROC曲线的绘制等。
第6章Kaplan-Meier曲线及其生存分析,详细介绍生存资料的分析。其中:分析方法涉及Kaplan-Meier分析、Log-Rank检验、风险比计算等;图形绘制涉及Kaplan-Meier生存曲线的绘制等。
第7章非线性回归,详细介绍连续型变量间非线性关系的分析方法与图形绘制。其中:分析方法涉及二项式回归、剂量-反应曲线、酶动力学-米氏方程、Gompertz生长曲线等;图形绘制涉及散点图、拟合曲线、剂量-反应曲线、米氏方程曲线、Gompertz生长曲线的绘制等。
第8章图形绘制实战,结合典型案例详细介绍28种图形及其变种图形的绘制,包括Bland-Altman图、森林图、堆积柱状图、双向柱状图、截断柱状图、多指标柱状图、簇状箱式图、条形图、面积图、序贯图、棒棒糖图、热图、柏拉图、时间轴图、平滑曲线图、气泡图、主成分分析图、直方图、火山图、调节效应图、交互效应图、人口金字塔图、曼哈顿图、瀑布图、悬浮条形图、局部图、象限散点图、嵌套图的绘制。
第9章多因素回归分析,详细介绍4种多因素回归分析方法,包括多因素线性回归、多因素Logistic回归、多因素Poisson回归、多因素Cox回归。
读者对象
GraphPad Prism入门人员;
GraphPad Prism进阶人员;
企事业单位负责数据报表的人员;
对GraphPad Prism感兴趣的人员;
高等院校和科研机构的从业人员;
高等院校本科生、硕士研究生和博士研究生;
相关培训机构的学员。
配套资源获取方式
本书赠送以下超值配套资源:
11小时教学视频;
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上述配套资源有两种获取方式:一是关注微信公众号(见书),回复数字47自动获取下载链接;二是在清华大学出版社网站上搜索到本书,然后在本书页面上找到资源下载栏目,单击网络资源按钮进行下载。
另外,读者也可以在B站等平台的作者主页上在线观看本书配套教学视频。
答疑支持
由于笔者水平有限,加之写作时间仓促,书中可能存在疏漏与不足之处,恳请广大读者批评与指正。读者在阅读本书的过程中如果有疑问,可以发送电子邮件获取帮助。
彭献镇
2025年5月
第1章 GraphPad Prism概述 1
1.1 GraphPad Prism简介 1
1.2 用户引导界面速览 2
1.3 操作界面速览 5
1.4 坐标轴格式 11
1.5 图形格式 15
1.6 小结 18
第2章 均数比较 19
2.1 两独立样本t检验 19
2.1.1 PCR循环阈值案例 19
2.1.2 差异显著性分析 20
2.1.3 绘制柱状图 25
2.2 配对t检验 28
2.2.1 饮食影响甘油三酯案例 29
2.2.2 差异显著性分析 29
2.2.3 绘制连线图 32
2.3 单因素方差分析 34
2.3.1 考试成绩案例 35
2.3.2 差异显著性分析 35
2.3.3 绘制柱状图 40
2.4 单因素重复测量方差分析 43
2.4.1 行为干预舒张压案例 44
2.4.2 差异显著性分析 44
2.4.3 绘制柱状图 48
2.5 双因素方差分析 52
2.5.1 幸福指数案例 52
2.5.2 差异显著性分析 52
2.5.3 绘制折线图 55
2.6 双因素重复测量方差分析 58
2.6.1 药物干预收缩压案例 58
2.6.2 差异显著性分析 58
2.6.3 绘制柱状图 62
2.7 三因素方差分析 65
2.7.1 小鼠体重分析案例 65
2.7.2 差异显著性分析 65
2.7.3 绘制柱状图 68
2.8 小结 70
第3章 相关性分析与线性回归 71
3.1 相关性分析 71
3.1.1 相关性分析的基本概念 71
3.1.2 腰围与体脂案例 73
3.1.3 相关性检验 73
3.1.4 绘制散点图与拟合直线 76
3.2 简单线性回归 79
3.2.1 线性回归简介 79
3.2.2 心率与电机械收缩时间案例 80
3.2.3 回归分析 81
3.2.4 绘制散点图与拟合直线 83
3.3 分层线性回归 87
3.3.1 不同性别的回归分析案例 87
3.3.2 分层分析 87
3.3.3 绘制散点图与拟合直线 90
3.4 小结 95
第4章 卡方检验 96
4.1 卡方检验的适用条件 96
4.2 列联表卡方检验 97
4.2.1 腰损伤穴位针刺治疗效果研究案例 97
4.2.2 卡方检验分析 97
4.2.3 图形绘制 99
4.3 筛检指标计算 103
4.3.1 心肌梗塞筛检案例 103
4.3.2 筛检指标计算 103
4.4 小结 106
第5章 ROC曲线绘制与分析 107
5.1 单变量ROC曲线的绘制与分析 107
5.1.1 ROC曲线的相关指标 107
5.1.2 原发性胆汁肝硬化研究案例 108
5.1.3 ROC曲线分析 109
5.2 两变量ROC曲线的绘制与分析 114
5.2.1 肝硬化研究案例 114
5.2.2 ROC曲线分析 115
5.3 小结 123
第6章 Kaplan-Meier曲线及其生存分析 124
6.1 Kaplan-Meier曲线 124
6.1.1 Kaplan-Meier曲线的常用术语 124
6.1.2 基因表达水平与死亡关系研究案例 125
6.1.3 Kaplan-Meier生存分析 127
6.2 小结 135
第7章 非线性回归 136
7.1 非线性回归的常用模型 136
7.2 二项式回归 137
7.2.1 住院天数与焦虑评分案例 138
7.2.2 二项式回归分析 138
7.2.3 绘制散点图与拟合曲线 140
7.3 剂量-反应曲线1 144
7.3.1 药物EC50研究案例 144
7.3.2 剂量-反应分析 145
7.3.3 绘制剂量-反应曲线 148
7.4 剂量-反应曲线2 151
7.4.1 两条曲线EC50研究案例 151
7.4.2 剂量-反应分析 152
7.4.3 绘制剂量-反应曲线 155
7.5 酶动力学-米氏方程 159
7.5.1 米氏方程案例 159
7.5.2 米氏方程分析 160
7.5.3 绘制米氏方程曲线 162
7.6 Gompertz生长曲线 166
7.6.1 男童身高案例 166
7.6.2 Gompertz模型分析 167
7.6.3 绘制Gompertz生长曲线 169
7.7 小结 173
第8章 图形绘制实战 174
8.1 Bland-Altman图 174
8.1.1 用不同方法测量血压值案例 174
8.1.2 绘制Bland-Altman图 175
8.2 森林图 180
8.2.1 阿司匹林与癌症关联案例 180
8.2.2 绘制森林图 181
8.3 堆积柱状图 188
8.3.1 月饼种类推荐案例 188
8.3.2 绘制堆积柱状图 189
8.4 双向柱状图 194
8.4.1 通路富集分析案例 194
8.4.2 绘制双向柱状图 195
8.5 截断柱状图 200
8.5.1 人群收入案例 200
8.5.2 绘制截断柱状图 201
8.6 多指标柱状图 206
8.6.1 炎症因子与代谢异质案例 206
8.6.2 绘制多指标柱状图 207
8.7 簇状箱式图 212
8.7.1 抢救前后疼痛评分案例 212
8.7.2 绘制簇状箱式图 213
8.8 条形图 217
8.8.1 疾病分类统计案例 217
8.8.2 绘制条形图 218
8.9 面积图 222
8.9.1 药时曲线案例 222
8.9.2 绘制面积图 222
8.10 序贯图 226
8.10.1 日间宫腔镜检查案例 226
8.10.2 绘制序贯图 226
8.11 棒棒糖图 231
8.11.1 GO富集分析案例 231
8.11.2 绘制棒棒糖图 233
8.12 热图 237
8.12.1 土壤理化特性相关性检验案例 237
8.12.2 绘制热图 238
8.13 柏拉图 242
8.13.1 产品缺陷案例 243
8.13.2 绘制柏拉图 243
8.14 时间轴图 247
8.14.1 年份时间轴案例 248
8.14.2 绘制时间轴图 248
8.15 平滑曲线图 252
8.15.1 不同年龄的BMI案例 252
8.15.2 绘制平滑曲线图 252
8.16 气泡图 258
8.16.1 GDP与期望寿命案例 258
8.16.2 绘制气泡图 258
8.17 主成分分析图 263
8.17.1 乳腺癌特征降维案例 263
8.17.2 绘制主成分分析图 263
8.18 直方图 268
8.18.1 老年人的收缩压案例 268
8.18.2 绘制直方图 268
8.19 火山图 272
8.19.1 TCGA基因表达案例 272
8.19.2 绘制火山图 272
8.20 调节效应图 277
8.20.1 服务满意度案例 277
8.20.2 绘制调节效应图 277
8.21 交互效应图 281
8.21.1 工作效率案例 281
8.21.2 绘制交互效应图 281
8.22 人口金字塔图 285
8.22.1 人口分布案例 285
8.22.2 绘制人口金字塔图 285
8.23 曼哈顿图 290
8.23.1 单核苷酸多态性案例 290
8.23.2 绘制曼哈顿图 290
8.24 瀑布图 294
8.24.1 谱分析案例 294
8.24.2 绘制瀑布图 294
8.25 悬浮条形图 298
8.25.1 空气质量指数案例 298
8.25.2 绘制悬浮条形图 298
8.26 局部图 301
8.26.1 学业等级案例 301
8.26.2 绘制局部图 301
8.27 象限散点图 305
8.27.1 专业发展前景案例 305
8.27.2 绘制象限散点图 305
8.28 嵌套图 309
8.28.1 牛的红细胞压积案例 309
8.28.2 绘制嵌套图 309
第9章 多因素回归分析 312
9.1 多因素线性回归 312
9.1.1 糖化血红蛋白案例 312
9.1.2 多因素线性回归分析 312
9.2 多因素Logistic回归 315
9.2.1 邮轮乘客存活案例 315
9.2.2 多因素Logistic回归分析 316
9.3 多因素Poisson回归 319
9.3.1 肿瘤复发次数案例 319
9.3.2 多因素Poisson回归分析 320
9.4 多因素Cox回归 322
9.4.1 冠心病患者生存案例 323
9.4.2 多因素Cox回归分析 323
9.5 小结 327