本书共分4篇，分别为理论基础篇、学术进展篇、中医病证诊疗篇、西医疾病诊疗篇。理论基础篇分别以中西医理论阐述消化系统的解剖、生理功能以及消化系统疾病的病因病理。学术进展篇将中西医理论、学术观点、研究进展进行了系统归纳与整理。中医病证诊疗篇对24种中医消化疾病分别按概述、病名沿革、病因病机、临床表现、诊断、鉴别诊断、辨证论治、中成药、中医适宜技术、西药治疗、名医经验、转归及预后等进行论述。西医疾病诊疗篇将57种消化系统疾病按发病部位分为食管、胃部、肠道、肝脏、胆系、胰腺及腹膜七个版块进行论述。