《马大正边疆文存》共为六卷，分别为《中国边疆学构筑论衡》《中国边疆治理与历史上民族关系研究》《新疆大历史的观察与思考·上》《新疆大历史的观察与思考·下》《新疆探察史研究》《边疆序跋与评议汇选》。该文存为马大正先生从事边疆研究40余年学术成果的总汇，其中既包括他对于中国边疆学这一学科理论框架、研究方法、知识体系的构想，又有关于新疆历史知识的普及。该套文存坚定中化民族多元一体和统一多民族国家的立场，对于当代中国边疆稳定、特别是新疆稳定与发展战略研究具有重要的借鉴意义。

马大正，中国历史研究院学术咨询委员会委员。中国社会科学院中国边疆研究所研究员、博士生导师。国家清史编纂委员会副主任。著有《马大正文集》（上海辞书出版社，2005年）、《漂落异域的民族——17至18世纪的土尔扈特蒙古》（中国社会科学出版社，1991年）、《新疆史鉴》（新疆人民出版社，2006年）、《当代中国边疆研究（1949—2014）》（中国社会科学出版社，2015年）、《中国边疆学构筑札记》（中央广播电视大学出版社，2016年）、《中国边疆治理通论》（湖南人民出版社，2015年）等。