《小儿推拿秘旨》全书共三卷。卷一论述了多种小儿常见病的病因、病机、诊断以及小儿常见病的推拿穴位和推拿治疗方法；卷二以歌诀形式叙述小儿常见病证及莫治疗方剂，主要为药物疗法；卷三为小儿常见病实用方，共列举有效方50个。本书内容丰富，记述了龚氏对小儿推拿的独到见解，并广集各家之长，为后世小儿推拿学的发展，奠定了坚实的基础。《小儿推拿秘旨》内容丰富，是理论和实践相结合的中医经典著作。