本书拟分为序、前言、领导关怀、正文、附录共五部分，正文部分共设九章，包括源流与变迁、业务轨迹、重要成果、国际合作与交流、能力建设、人才队伍、党建与文明创建、荣誉与奖励、思考与展望等。本书有效彰显研究所团结创新、和谐奋进的文化底蕴，全面支撑服务流域水生态保护综合治理管理，长远助力长江大保护和国家生态文明建设。