《女神异闻录5》的漫画单行本是ATLUS原作，村崎久都作画的漫画作品。因为帮助路人反遭诬陷获罪，主人公来栖晓不得不离开当地，转入大都会中的秀尽学园高中。转校第一天，他就与偶然邂逅的“不良少年”坂本龙司一起误打误撞进了一座被称作殿堂的神秘城堡。当晓被自称殿堂之王的教师—鸭志田捕获时，他觉醒了反抗意志的力量“人格面具”！晓与龙司获得了在殿堂内遇到的神秘猫咪—摩尔加纳的协助，好不容易逃出了殿堂，但鸭志田的恶行已经在学校里酿成了更可怕的悲剧……