在“双一流”背景下，高校十分注重内涵式发展。加强高校科研绩效评价，是提高科研经费使用效率的必然选择，是提升高校科研能力的必要措施，亦是监督，执行，反馈科研活动的重要手段。结合当下高校发展的趋势，基于高校不同学科的特点，从科研经费，社会评价，科研效率，学习成长等四个维度，构建出高校科研绩效评价指标体系，运用平衡计分卡原理确定各指标权重，对高校科研绩效评价管理进行应用分析，就优化完善我国高校科研绩效评价管理体系提出对策建议，以期对高校科研绩效评价工作提供新思路和新方向。