本研究以区域海洋生物多样性保护、规划和管理为对象，运用理论与实证相结合的跨学科整合性研究方法，基于海洋生物多样性全球治理理念和制度框架，将现有不同层面的规划和管理工具运用生态系统方法协调与综合，融入到区域化治理的发展进程中，探索构建以海洋生物多样性保护为核心的区域海洋治理整合性运行体系，并为特定政治和社会经济条件下区域(即南中国海区域)的实践模式和策略选择提供科学、合理和可行的策略建议。