《孝经郑氏注笺释》三卷并《孝经校释》一卷，是曹元弼《孝经》学的代表作。曹氏先列经文，其后考注，再为笺释。而其考注，有时录郑注他经之文以补全之。 与《孝经学》的略释大义不同，《孝经郑氏注笺释》极尽精详。在这本书中，他重构了《孝经》与六经的关系，并且以《孝经》学的爱敬之理贯穿、统摄六经，建构了一个新的经学体系。简言之，就是以《孝经》会通六艺。曹元弼的种种努力，是为了重建在近代变革中被冲击和瓦解的经学，构建起以人伦、爱敬为宗旨，以礼为体，六艺同条共贯之经学体系