全书分为七章：如何读懂南京、南京古城范围、“东夏”六朝、南唐风云、天国”不太平、大明王朝、“七朝古都”的八大文化板块。总体按照历史年代顺序，采用历史学、考古学、文化遗产等多学科研究方法，讲述了南京的建城发展史和南京在中国历史上的重要地位。本书对南京“六朝古都”的传统表述提出了质疑，并结合历史文献、出土文物等充分论据，在东吴、东晋、南朝宋、南朝齐、南朝梁、南朝陈六个朝代的基础之上增加了明朝，提出南京是“七朝古都”的形象判定，为南京历史文化研究和南京城市建设提供了更加全面、深刻和科学的理论支撑。