本书分九州、导山、导水和五服四部分。《禹贡水道考异》一书正是对“导水”这一部分的考异注解。《禹贡水道考异》凡例中提及“禹贡导水分南北二条, 北以河为经, 南以江汉为经”, 原书也据此分为《南条水道考异》、《北条水道考异》两编, 每编各五卷。据序言, 作者整合汉唐以来多家《禹贡》注家的说法, 进行考异, 而因为作者属于南方人, 《南条》涉及的水道多亲眼所见, 多有实地考察经验, 而《北条》还是根据各家注解考异。