本书共三编, 上编集中讨论晚明佛教与其时宫廷政治的关系, 通过聚焦慈圣李太后奉佛及礼事高僧、崇祯帝在本土释道与外来天主教之间的选择、憨山德清乙未之狱、紫柏真可“妖书案”等事件。中编围绕“方册藏”的刊刻事业, 展示高僧与奉佛士大夫之间的互动。下编则是探讨晚明佛教的多种成色及其表现, 仍是以不同的个案, 展示这个时代信仰生活的多元特征。