本书是以综合内容呈现的系列探案主题书。书中包含五个主要栏目: 案件故事 (每本书5个案件)、侦探知识库、侦探科学实验、侦探能力测试、柯南大百科问答。本书分别选取名侦探柯南动画中的《流经流水亭的意外》《少年侦探队消失的事件》《与黑衣组织再次重逢》《红色梦幻曲》《诅咒假面的冷笑》5个名探案故事, 以抓帧漫画形式讲述案件故事。每个案件里包含出场人物、线索提示等。线索提示藏在故事中, 读者可以通过柯南线索揭秘卡才能看到相关破案线索。