时刻裂口所造成的破坏, 引起全世界的愤怒。为了负起责任, X基地被迫解散, 而X探险特工队因此各奔东西。回到校园生活的小宇, 在睡梦中被带到一个机械工房, 一觉醒来就遭到来历不明的恐龙袭击, 小宇只好穿上机械服与之对抗。危急中, 有另一架机器人及时相助, 而操纵者竟是……