《疾病分子诊断学：分子检测应用指南》英文原版著作由临床分子诊断领域的知名专家William B. Coleman，Gregory J. Tsongalis博士主编。本书不仅介绍了分子诊断的基础理论、基本技术和进展，还指导读者如何根据不同传染病、实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病和药物基因组学的临床特征运用不同的临床分子诊断技术做出精准的诊断，以获得的临床治疗效果。本书将为在病理科、临床检验和基础研究实验室从事分子诊断和研究的专业人员带来前沿的专业知识。

分子诊断是全球体外诊断行业发展快的领域。在各种政策利好、不断增长的精准医疗需求的推动下，我国的临床分子诊断专业进入井喷式发展阶段。各种规模的分子诊断实验室建设已经下沉到基层医疗机构，但是专业人员培训和相关知识的普及还亟待加强。本书作为分子诊断领域的权威参考书，具有以下突出特点：
1.本书由分子诊断领域的知名学者编写和翻译，内容涵盖本领域的基本知识和进展，是近年来一本非常值得借鉴的学习工具书。
2.打破临床病理学、检验医学和基础医学的学科界限，通过介绍不同疾病的临床表现及其在不同病程阶段所发生的分子事件，指导读者使用不同的分子诊断手段对患者实现个体化治疗。
3.书中包涵大量的示意图，将抽象的分子诊断知识形象化，便于读者快速理解吸收。

病理学是一门研究疾病的性质、诱因、进程、发展及结局的科学。病理学领域源自应用科学技术去研究人类疾病。因此，病理学是医学和基础科学交叉学科。早期的病理学家一向由执业医师担任，他们描述治疗过的各种疾病，观察导致这些疾病发展的相关因素。随着时间的推移，基于光学显微镜和电子显微镜的出现，人们对疾病粗略的观察逐渐演变为对病变组织结构和超微结构的仔细检测。随着医院和社区疾病登记的普及，研究者能够确定引起疾病的因素，并规避这种特殊暴露风险，这增加了我们对疾病流行病学的认识。描述病理学可以追溯到早有文字记载的医学史。现代诊断病理实践大概可以追溯到 200 年前，从阐明疾病的发病机制和疾病发病机制的联系，到近期从实验病理研究中发现具体的致病因素。实验病理学体现了早期病理学的基础概念应用科学的方法去研究疾病，以及应用现代的细胞和分子生物学研究工具来改进动物模型系统和研究人体受试者。然而生物科学的分子时代始于 50 多年前，我们对疾病分子机制的认识进展推动了分子病理学领域发展。针对分子生物学中常态环境和病态环境对于细胞、组织和器官的影响问题，相关技术和实验方法已得到显著的更进和新兴拓展，从而催生了上述进展。今天，分子病理学围绕研究疾病的分子机制、转化医学的相互作用，新的基础科学的发现是形成新的治疗方法和靶向治疗新策略的基础，从而预防和治疗疾病。分子诊断病理学是聚焦于利用分子特征和疾病发病机制，发展实用性的分子诊断工具来检测、诊断以及预测疾病的新领域。分子诊断病理学对于实现真正的个体化医疗是至关重要的。这个领域正在不断地扩大、成熟，新出现的分子检测技术将会在人类疾病敏感和特异的检测、诊断和预测中更实用。久而久之，分子技术需要将会越来越多、越来越经济实用，病人无论是在医疗中心还是在社区医院治疗都可以轻易获得。
随着分子病理诊断学领域科学发现的显著进步，基础科学家、临床科学家和内科医生们需要一本信息资源书，包含当前的人类疾病的分子基础知识以及我们如何利用这些疾病的分子特征进行实用的分子检测。更重要的是，系统和有效地训练今天的研究生们、医学生们、博士后研究者，以及其他研究和治疗人类疾病的相关职业者，都需要这本包含了我们当前对疾病的发病机制的分子机制的知识和转化医学相关的新兴概念的书。我们为本书《疾病分子诊断学：分子检测应用指南》组建了一个专家组，讨论了在传统病理学背景下出现的人类主要疾病和疾病过程的分子基础和机制以及如何有效利用这些疾病的分子特征来开发有效的分子检测去解决不易检测、诊断、预测的问题。本书作为一本多用途的教科书，可以作为医学生、生物医学研究生、专职医疗学生和其他人（如优秀的本科生）的课堂教学工具。此外，这本书对病理学家和其他博士后研究者来说也很有价值，他们可以借此提高对疾病分子机制的理解和掌握更多与这些机制相关的实用知识，扩充他们在医学院 / 研究生院所学到的知识。
另外，对于进行相关疾病基础研究和转化研究的执业基础医学家和医师科学家来说，他们需要一本现成的信息资源，包括关于各种人类疾病和疾病状态的分子基础、患者在现代化的医院实验室中检查所用到的分子检测技术，本书是非常有用的参考书。诚然，我们对人类疾病发展的许多原因和分子机制的理解还远远不够，对所有人类疾病的分子检测尚不能做到，但近年来有关人类疾病分子机制的实际开发量急剧增加，区域主题和概念的共识已经出现。我们希望《疾病分子诊断学：分子检测应用指南》能够达到让学生、研究人员、医师深入了解主要人类疾病的分子基础和相关分子检测的目的，从而激发我们通过新的研究来发展新的分子技术和检测，帮助我们进一步理解人类疾病的分子机制和分子医学实践。
William B.Coleman
Gregory J.Tsongalis
（陶子骄　译，苏东明　校）

苏东明：南京医科大学病理学系教授、博士生导师；南京医科大学附属逸夫医院临床病理与检验中心主任；现任中国病理医师协会委员等。
梁莉：南方医科大学基础医学院病理学系/南方医院病理科主任、教授、主任医师、博导；现任中国抗癌协会肿瘤转移委员会副主任委员、中国医促会病理学分会副主任委员、中国病理医师协会数字病理与人工智能病理学组组长及《诊断病理学杂志》副总编辑等。

部分 分子实验介绍
1. 分子病理学的基本概念人类疾病分子检测方法导论 W.B. Coleman 和 G.J. Tsongalis
前言/ 2
突变和表观突变/ 3
用于分子检测的核酸样本来源/ 3
疾病的分类/ 4
疾病的分子分型/ 4
分子检测和伴随诊断/ 7
疾病的分子检测/10
疾病的分子诊断/11
疾病的分子预测/11
展望/12
参考文献/12
2. 分子病理的实验室检测方法聚合酶链式反应 W.B. Coleman 和 G.J. Tsongalis
前言/14
聚合酶链式反应/14
构成 PCR 反应的基本成分 /16
PCR 反应的优化 /17
PCR 反应特异性和灵敏性的提升 /17
PCR 反应中的污染问题 /17
PCR 反应的抑制剂 /18
PCR 扩增产物的分析 /18
基于常规 PCR 的派生技术 /18
参考文献/20
3. 下一代测序在临床实验室中的应用 D.L. Duncan 和 N.M. Patel
前言/22
DNA 测序化学 /23
计算机科学/25
序列解读和临床报告/27
结论/28
参考文献/28
4. 分子诊断实验室的自动化 S.A. Turner 和 G.J. Tsongalis
前言/29
核酸提取的自动化/31
传染性疾病分子诊断中的自动化/32
遗传学与分子肿瘤学诊断中的自动化/33
结论/37
参考文献/37
第二部分 传染病的分子检测
5. 人类免疫缺陷病毒的分子实验技术 M. Memmi，T. Bourlet 和 B. Pozzetto
前言/42
HIV 感染和 AIDS 背景 /42
HIV 感染诊断和随访中的分子工具 /43
特定临床状况下采取 HIV 分子诊断技术的要点/46
HIV 分子检测的新思路 /48
结论/51
参考文献/51
6. 病毒感染性肝脏疾病的分子检测 P.M. Mulrooney-Cousins 和 T.I. Michalak
前言/54
HAV 和 HAV RNA 的检测 /54
HBV 感染 /55
HCV 和 HCV RNA 的检测方法 /58
HDV 和 HDV RNA 检测方法 /60
HEV 和 HEV RNA 检测 /60
GB 病毒 C 和 GB 病毒 C 基因组的分子检测/61
参考文献/61
7. 人乳头瘤病毒的分子检测 K.M. Bennett
前言/64
分子靶标/64
分子诊断技术/66
临床用途/72
局限性/73
参考文献/73
8. 疱疹病毒的分子检测 S.K. Tan 和 B.A. Pinsky
前言/76
单纯疱疹病毒/76
水痘带状疱疹病毒/79
EB 病毒 /79
巨细胞病毒/80
人类疱疹病毒 -6 型 /81
人类疱疹病毒 -7 型 /82
人类疱疹病毒 -8 型 /83
结论/83
参考文献/83
9. 微小病毒的分子检测 G. Gallinella
微小病毒科/88
微小病毒 B19 /88
分子靶点/90
分子技术/91
临床应用/92
参考文献/94
10. 多瘤病毒的分子检测 G.W Procop 和 B. Yen-Lieberman
前言/98
分子检测的靶基因/98
分子检测的技术/99
临床应用/ 100
检测的局限性/ 101
参考文献/ 102
11. 呼吸道病毒的分子检测 K.A. Stellrecht
前言/ 105
分子靶标/ 105
呼吸道病毒感染分子诊断的临床应用/ 110
分子检测技术及其局限性/ 112
结论/ 115
参考文献/ 115
12. 细菌感染性疾病的分子检测 R. Plongla 和 M.B. Miller
前言/ 119
细菌的鉴定/ 119
呼吸道感染/ 121
胃肠道感染/ 122
血流感染/ 124
B 群链球菌筛检 / 126
对未来的展望/ 126
参考文献/ 127
13. 经性传播感染的病原体 P. Verhoeven，F. Grattard，S. Gonzalo，M. Memmi 和 B. Pozzetto
前言/ 130
梅毒/ 131
淋病/ 131
生殖道的沙眼衣原体感染/ 133
生殖道的支原体感染/ 134
滴虫病/ 134
未来的方向/ 135
结论/ 137
参考文献/ 137
14. 医源性感染的分子诊断 R.C. Arcenas
前言/ 140
MRSA 的分子诊断和临床应用 / 141
MRSA 的分子分型及临床应用 / 143
MRSA 分子筛查 / 监测 / 145
艰难梭菌/ 145
艰难梭菌的分子诊断和临床应用/ 146
艰难梭菌分子诊断和临床应用/ 148
参考文献/ 148
15. 新兴传染病的分子检测 J. Dong，N. Ismail，D. H. Walker
新兴传染病的背景和分类/ 153
运用分子生物学方法发现新兴传染性病原体/ 153
新兴传染性病原体的分子流行病学研究/ 166
新兴传染病病原体的分子诊断/ 167
当前检测的局限性及未来展望/ 168
参考文献/ 170
第三部分 遗传病的分子检测
16. 无创性胎儿染色体非整倍体产前筛查 W. E. Highsmith，M. A. Allyse，K. S. Borowski 和 M. J. Wick
前言/ 176
分子靶标：利用血浆核苷酸进行检测的方法/ 177
分子技术与临床应用：四个商业实验室所采用的四种不同方法/ 177
检测的局限性/ 181
总结与展望/ 182
参考文献/ 182
17. 遗传性心肌病的分子检测 H. M. McLaughlin 和 B. H. Funke
前言/ 184
心肌病的主要类型/ 184
分子生物学病因/ 188
分子技术/ 189
临床应用/ 189
检测的局限性/ 190
参考文献/ 190
18. 凝血疾病的分子诊断 M.B. Smolkin 和 P.L. Perrotta
前言/ 192
分子靶点/ 193
临床应用/ 200
检测的局限性/ 200
参考文献/ 201
19. 囊性纤维化的分子诊断 Y. Si 和 D.H. Best
前言/ 204
分子靶点/ 205
分子技术/ 207
临床应用/ 208
检测技术的局限性/ 210
参考文献/ 210
20. 血色素沉着病的分子检测 P. Brissot，O. Loreal 和 A.-M. Jouanolle
前言/ 213
疾病机制的背景/ 213
HC 诊断的临床策略 / 215
临床个体化的分子检测方案/ 216
用于家族筛查的临床分子检测方案/ 217
分子生物学的方法和策略/ 218
展望/ 218
结论/ 219
参考文献/ 219
第四部分 肿瘤的分子检测
21. 乳腺癌的分子检测 K.H. Allison
前言/ 222
荧光原位杂交法检测 HER2 / 222
乳腺癌的分子亚型/ 226
预后指标与化疗疗效的评估/ 228
结论/ 230
参考文献/ 230
22. 前列腺癌的分子病理学 A.M. Udager，S.C. Smith 和 S.A. Tomlins
前言/ 234
分子靶点/ 235
分子生物学技术/ 236
临床应用/ 241
检测局限性/ 243
参考文献/ 245
23. 肺癌的分子检测 C.J. Shiau 和 M.-S. Tsao
前言/ 248
分子靶标/ 250
分子技术/ 254
检测局限性/ 255
临床应用/ 256
参考文献/ 258
24. 结直肠癌的分子检测 J.S. Thomas 和 Chanjuan Shi
前言/ 263
结直肠癌的遗传学途径/ 263
遗传性结直肠癌综合征/ 264
结直肠癌靶向治疗的生物标志物/ 267
分子技术、临床效能和检测局限 / 269
参考文献/ 275
25. 黑色素瘤的分子病理学和分子检测 A.A. Hedayat，S. Yan 和 G.J. Tsongalis
前言/ 278
黑色素瘤相关疾病和综合征/ 278
黑色素瘤的分子分析/ 279
黑色素瘤的分子检测/ 283
结论/ 289
参考文献/ 289
26. 胶质母细胞瘤的分子检测 D.G. Trembath
分子靶标/ 294
分子检测技术/ 297
临床应用/ 299
研究的局限性/ 300
参考文献/ 301
27. 胰腺癌的分子检测 M.J. Bartel，S. Chakraborty 和 M. Raimondo
前言/ 303
血清中的 PDAC 生物标志物 / 303
胰液中的 PDAC 生物标志物 / 305
粪便中的 PDAC 生物标志物 / 311
尿液中的 PDAC 生物标志物 / 311
唾液中的 PDAC 生物标志物 / 311
第五部分 血液病理学的分子检测
32. 慢性粒细胞白血病的分子检测 N.A. Brown 和 B.L. Betz
前言/ 358
慢性粒细胞白血病的分子生物学/ 358
分子方法/ 359
测试的指示及结果/ 361
结论/ 362
参考文献/ 363
33. 急性髓系白血病的分子检测 A. Behdad 和 B.L. Betz
前言/ 364
AML 的诊断 / 365
AML 的细胞遗传学异常 / 365
AML 的基因突变 / 368
微小残留病灶（MRD）的检测 / 374
新视野/ 374
参考文献/ 375
结论/ 312
参考文献/ 312
28. 妇科恶性肿瘤的分子检测 S.E. Kerr
前言/ 315
HPV 和宫颈癌 / 315
妊娠滋养细胞疾病/ 318
子宫内膜间质肉瘤/ 321
成人型颗粒细胞瘤/ 323
子宫内膜癌中林奇综合征的筛查/ 325
妇科癌症分子检测的展望/ 328
参考文献/ 329
29. 肾癌新兴遗传观 K. Willoughby 和 H.A. Drabkin
前言/ 332
分子靶点和检测技术/ 333
临床应用/ 337
分子检测的局限性/ 337
参考文献/ 338
30. 甲状腺癌的分子检测 S.J. Hsiao 和 Y.E. Nikiforov
前言/ 340
甲状腺癌诊断中的分子靶点/ 340
分子检测技术/ 342
临床应用/ 343
检测的局限性/ 344
参考文献/ 345
31. 儿科恶性肿瘤的分子检测 K.R. Crooks 和 K.W. Rao
前言/ 348
视网膜母细胞瘤/ 348
Wilms 瘤 / 349
神经母细胞瘤/ 352
参考文献/ 355
34. 骨髓增殖性肿瘤的分子检测 L.V. Furtado 和 B.L. Betz
前言/ 379
MPN 的分子发病机制 / 379
MPN 的分子检测 / 381
MPN 检测的分子方法 / 382
未来展望/ 386
结论/ 386
参考文献/ 386
35. 评估骨髓移植的分子检测 J.K. Booker
前言/ 390
分子靶标/ 390
分子学技术/ 391
临床应用/ 392
检测方法的局限性/ 392
参考文献/ 393
36. 心血管疾病的个体化药物治疗 R.M. Turner，M. Bula 和 M. Pirmohamed
前言/ 396
华法林/ 399
硫酸氢氯吡格雷/ 401
他汀类药物/ 403
布新洛尔/ 404
结论和未来展望/ 406
参考文献/ 407
37. 凝血障碍性疾病的个体化医疗 J. Fareed 和 O. Iqbal
前言/ 410
凝血疾病的基因组学/ 415
抗血小板药和抗凝药的药物基因组学/ 416
出血疾病的基因组学与血友病治疗的个体化/ 419
参考文献/ 420
38. 丙型肝炎的个体化治疗 A. Ferreira-Gonzalez
前言/ 422
丙肝的抗病毒治疗/ 424
开始丙肝治疗的时间和对象/ 426
HCV 感染的初步治疗 / 427
监测开始接受 HCV 治疗、正在治疗或完成治疗的患者/ 429
病毒抗性变异/ 431
宿主药物遗传学在预测 HCV 治疗结局中的作用/ 433
参考文献/ 434
39. 肿瘤的个体化治疗 V.M. Pratt 和 S.A. Scott
前言/ 438
分子靶标：氟嘧啶类和 DPYD / 438
分子靶标：伊立替康和 UGT1A1 / 440
分子靶标：拉布立酶和 G6PD 缺乏症 / 440
分子靶标：三苯氧胺和 CYP2D6 / 442
分子靶标：巯基嘌呤类药物和巯基嘌呤甲基转移酶/ 444
在实施肿瘤个体化治疗时需要考虑的其他问题 / 445
参考文献/ 446
第六部分 个体化医疗中的分子检测
40. 质谱成像在临床病理学中的应用 J.L. Norris，D.B. Gutierrez 和 R.M. Caprioli
前言/ 450
质谱成像/ 451
解剖病理学的应用/ 453
IMS 中的计算方法 / 456
结论/ 459
参考文献/ 459
41. 全基因组测序在分子病理实验室中的应用 G.T.Haskell 和 J.S.Berg
前言/ 462
分子技术/ 462
全基因组测序是否增加临床效用？/ 466
全基因组测序的应用前景/ 468
全基因组测序技术的展望/ 469
参考文献/ 469