《古今治河图说》是一本用文字与地图形式讲述黄河变迁的专业性读物。以黄河六次变迁为主线，引用了《尚书》关于禹河形成的论述，时间跨度从史前一直到1938年；在讲述历史事件河流变迁时，详细列出相关地区、市镇的名称，并用四十幅精细地图表达，更为直观，易于查找和记忆；注重人的作用和政治事件的影响，把大自然、人、社会结合在一起分析，介绍了若干中国历史上重要的治水人物和其中成败的关键，如：大禹、鲧、贾让、王景、贾鲁、潘季驯、靳辅等；提出根治黄河的设想，引用国内外专家治理黄河的见解，包括：根治的指导方针，降水与径流预告的测量，泥沙问题，上、中、下游分别治理的九种措施。

前言
出版说明
章 概论
第二章 禹河
节 禹河之前身
第二节 禹河
第三章 河大徙一（周定王河）
节 大徙之征兆
第二节 周定王河
第四章 河大徙二（王莽河）
节 瓠子之决
第二节 贾让三策
第三节 王莽河
第四节 王景治绩
第五章 河大徙三（宋代商胡大河）
节 汉宋间分流之害
第二节 宋代商胡大河
第六章 河大徙四（金明昌大河）
节 宋代回河之失（上）
第二节 宋代回河之失（中）
第三节 宋代回河之失（下）
第四节 金明昌大河
第七章 河大徙五（明弘治大河）
节 黄河夺淮之初步
第二节 贾鲁治绩
第三节 明代河患
第四节 明弘治大河
第八章 河大徙六（清咸丰大河）
节 潘季驯治绩
第二节 靳辅治绩
第三节 康乾之治
第四节 乾嘉河决及塞治
第五节 清咸丰大河
第九章 近代大河
节 近代大河之形成
第二节 近代河患及塞治（一）
第三节 近代河患及塞治（二）
第四节 河防行政
第十章 黄河利病及治法
节 河性通论
第二节 水流
第三节 泥沙
第四节 治法（上）
第五节 治法（中）
第六节 治法（下）
第十一章 结论
勘误表
后记
与吴君勉相关的出版物、手稿
参考文献