杵针疗法为中国医经所未载，《道藏》亦未见记述。在秘传过程中，只是口传其方法，无文字记载。
　　然而其学术思想源于羲黄古易，其辨证、立法、取穴、布阵多寓有《周易》《阴符》、理、气、象、数之意，与中医学理论水乳相融。该法治病时不用汤药，针具不刺入皮肤之内，工具制作简单，取穴简单，手法简易，操作简便，无疼痛之苦，无交叉感染之虑，兼针刺与按摩之长，老弱妇孺无忌。在长期的临床应用中，很受患者的欢迎。《李氏杵针流派临床经验辑要》体现了李老先生的深厚学术思想，更多的是李老先生的临床经验总结和验案整理，还体现了李老先生的独特诊疗技术在临床上的应用。

第一章 李氏杵针流派源流
第一节 李仲愚小传
第二节 李氏杵针流派源流
第三节 略述李仲愚先生学术思想与师承途径

第二章 家传绝技道家秘技
第一节 杵针疗法
第二节 马丹阳与“天星十二穴”
第三节 指针
第四节 独创奇穴疗效非凡

第三章 针灸论谈
第一节 针灸核心经穴疗法
第二节 针灸特长透穴疗法
第三节 广义迎随
第四节 大艾灸的临床应用

第四章 用药心得
第一节 重视外治提高疗效
第二节 善用古方灵活变通
第三节 用药精炼重在辨证

第五章 医案集锦
第一节 疑难杂症举例
第二节 治验三则

第六章 学术探讨
第一节 医易合壁发扬古易
第二节 从至阴穴转胞胎谈对经络及腧穴之体会
第三节 传统医学的几个基本问题

第七章 学习进阶
第一节 浅谈杵针疗法的哲学思想
第二节 背腧穴杵针疗法调治亚健康状态30例临床体会
第三节 杵针与独活寄生汤结合治疗腰痛的心得体会
第四节 杵针手法应用体会
第五节 杵针特殊穴位浅析
第六节 癌症不是绝症
第七节 中医养生之道
附录
附1 李仲愚先生年谱
附2 对发展中医事业的十点建议——李仲愚先生致彭真委员长“振兴中医”上书要点
附3 彭真同志就老中医李仲愚写信反映中医工作中几个问题的批示