《寒瘟条辨摘要》分上下两卷，上卷开篇首列瘟病根源证治与伤寒不同辨，随后分别详列瘟病与伤寒六经证治不同辨、四掼不可正治辨、瘟病与伤寒不同诊脉、大头瘟六证、瘟病诸下证及有关杂病及妇、儿科瘟病。下卷则备载洽瘟病诸方，以升降散为诸方之首，皆配以歌诀。本次整理以清嘉庆十六年辛未新繁沈氏刻本为底本。

卷上
瘟病根源证治与伤寒不同辨
杂气说
瘟病与伤寒六经证治不同辨
四损不可正治辨
瘟病与伤寒不同诊脉议
瘟疫以辨证为要其状多端特为揭出以便认识
大头六证乃瘟病之最重且凶者伤寒无此证故特揭出
瘟疫无正发汗之理惟下证最多并为指明

卷下
瘟病正治诸方
轻清之剂
表里三焦大热清剂
清后不解下剂
重泻之剂
半表半里之剂
清下壮水之剂
下后虚极之剂
瘟病杂证诸方
愈后调治诸方
备用诸方
又：补遗诸方
附：治诸瘟六方
又附：治小儿葡萄瘟方
校注后记