《云林医圣普渡慈航》乃明代著名医家龚廷贤于崇祯元年（1628年）九十高龄时撰著，并由其子龚定国协助完成，于崇祯五年（1932年）付梓。本书以德、侔、天、地、道、贯、古、今为序，分为8卷，内容包括医论及内、外、妇、儿各科病证160余种，是一部综合性医学著作。全书论病辨证，以临证为据，逐条分述；选方用药，切合实用，并附病案治验，颇有临床参考价值，广泛适用于中医药临床人员和中医药院校师生及中医自学者学习参考。
明朝“医林状元”龚廷贤晚年撰著。千挑万选，皆是精华。
明 龚廷贤（1538—1635），字子才，江西金溪县云林镇人，自幼习孔孟之书，有志于圣贤之学，稍长读史，极羡范仲淹“不为良相，便为良医”之说，从其父西园公学岐黄之术，认为既可养亲，又可治身，且利天下，故深究此道，被荐于朝，授予御医之职。人称“医林状元”“回天国手”。壮年归家乡，勤于著书，老而弥笃，曰：“与其以吾操一人之术以授天下，孰若传之于书，以救万劫之迷哉！”著有《古今医鉴》《万病回春》《云林神彀》《鲁府禁方》《寿世保元》等书行于世。龚廷贤于崇祯元年，以九十高龄，殚精竭虑，手不停批，口不绝吟，目不停瞬，撰著《云林医圣普渡慈航》一书，并由其子龚定国加工润色而成。龚氏在“自序”中云：“名医圣者，不忘吾幼习孔孟之义；名慈航者，志吾寸心普济之初也。”此书于崇祯五年春由金阊书林付梓，真可谓“药可施，方可传，书可布”也。
《云林医圣普渡慈航》序 1
《普渡慈航》自序 3
《普渡慈航》跋 4
御医云林龚先生赞辞 5
御医云林龚先生像赞 6
云林医圣增补医鉴回春卷之一 7
太医精诚论 7
不知易不足以言医 8
养真论 10
脉 论 11
诊脉切要歌 14
病源证治 15
药性共三百味 17
运 气 28
亢制论 31
中 风 33
附预防中风 46
附伤风 47
中 寒内附阴症 48
云林医圣普渡慈航卷之二 52
伤 寒 52
伤寒温热病治法 55
伤寒虚冷病治法 57
瘟 疫 70
瘴 气 73
蛊 毒 74
中 暑 76
中 湿 79
燥 证 81
火 证 83
内 伤 85
伤 食附伤酒 90
附伤酒方 93
调补脾 胃 94
郁 症 97
痰 饮 98
咳 嗽 105
喘 证 110
哮 吼 112
云林医圣普渡慈航卷之三 114
疟 疾 114
证治馀例 119
痢 疾 120
证治馀例 124
泄 泻 125
证治馀例 130
霍 乱 131
霍乱死证 131
证治馀例 134
发 沙 134
青 筋 135
呕 吐 136
恶 心 139
翻 胃 140
证治馀例 144
呃 逆 145
嗳 气 146
吞 酸 147
吐 酸 148
嘈 杂 149
诸 气 150
痞 满 155
鼓 胀 156
水 肿 159
积 聚 165
五 疸 170
云林医圣普渡慈航卷之四 173
补 益 173
证治馀例 185
老 人 186
发 热 188
证治馀例 191
劳 瘵 191
失 血 207
吐 血 209
证治馀例 211
衄 血 212
唾 血 213
咳 血 213
咯 血 213
呕 血 214
肠 澼 214
恶 热 216
恶 寒 217
自汗盗汗 219
证治馀例 222
眩 晕 222
麻 木 224
证治馀例 227
痓 病 227
癫 狂 228
证治馀例 229
五 痫 230
证治馀例 232
健 忘 232
证治馀例 234
惊 悸 235
证治馀例 237
怔 忡 237
证治馀例 238
虚 烦 238
不 寐 239
厥 证 240
邪 祟 241
中 恶 242
五 绝 243
云林医圣普渡慈航卷之五 244
心 痛 244
证治馀例 248
腹 痛 249
证治馀例 252
腰 痛 253
胁 痛 256
臂 痛 258
背 痛 260
疝 261
脚 气 265
证治馀例 269
鹤膝风 270
痛 风 272
证治馀例 275
不 仁 276
痿 躄 277
证治馀例 279
头 痛 279
证治馀例 283
须 发 284
证治馀例 286
唇 病 287
面 病 288
耳 病 290
证治馀例 293
鼻 病 293
口 病 295
舌 病 296
牙 齿 298
证治馀例 302
眼 目 303
证治馀例 310
咽 喉 311
证治馀例 315
声 哑 315
结 核 317
瘿 瘤 318
肺痈 肺痿 319
心 漏 320
云林医圣普渡慈航卷之六 321
消 渴 321
证治馀例 323
浊 证 324
证治馀例 326
梦 遗 327
证治馀例 330
淋 证 331
尿 血 333
遗 尿 333
小便频 334
小便闭 335
大便闭 337
二便闭 339
关 格 340
痔 漏 341
脱 肛 345
诸 虫 346
体 气 348
妇人科 349
总 论 349
调 经 350
证治馀例 355
经 闭 355
证治馀例 358
虚 劳 359
崩 漏 362
证治馀例 364
带 下 365
证治馀例 367
求 嗣 368
云林医圣普渡慈航卷之七 373
妇人科 373
妊 娠 373
产 育 381
产 后 385
产后诸症 385
产后石瘕 386
乳 病 394
通 乳 395
乳 痈 396
乳 岩 397
妇人杂病 397
小儿科 399
急 惊 403
慢 惊 405
慢 脾 406
疳 疾 407
癖 疾 409
热 证 412
感 冒 413
伤 食 414
吐 泻 414
痰 嗽 416
疟 疾 417
痢 疾 417
鬾 病 418
小儿初生要法 419
断脐法 419
免痘方 420
小儿初生百病 420
痘 疮 427
痘疮歌 428
发热治法 429
初出治法 429
起胀治法 432
收靥治法 436
痘后余毒 436
麻 疹 437
云林医圣普渡慈航卷之八 441
外科诸证 441
痈 疽 441
瘰 疬 448
疔 疮 451
便 毒 453
下 疳 454
杨梅疮 456
臁 疮 458
疥 疮 460
癣 疮 461
痜 疮 463
癜 风 464
厉 风 465
诸 疮 467
杖 疮 469
折 伤 470
金 疮 472
破伤风 473
汤 火 475
虫 兽 475
中 毒 476
骨 鲠 478
膏 药 479
通 治 481
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