细菌是经典食物网与微食物网的连接者，在水生生态系统物质循环中具有极其重要的地位。在蓝藻水华占优势的湖泊生态系统中，大量的物质和能量由蓝藻合成后被细菌分解、利用。蓝藻水华的暴发势必对湖泊细菌的群落结构组成产生影响。然而，有关该方面的研究极其缺乏。《蓝藻水华对湖泊细菌群落结构的影响》借助多种微生物生态学技术，通过野外调查和原位围隔实验相结合，探讨不同环境（有氧、缺氧、厌氧）、不同微囊藻生物量下细菌群落结构的变化及其恢复情况，以期了解细菌群落结构对蓝藻水华的响应及其机制，为阐明
蓝藻水华稳定态系统维持机制提供理论基础。

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目录
第1章绪论 1
1.1问题的提出2
1.2分子生物学技术在湖泊细菌群落结构组成研究中的应用 3
1.2.1克隆文库分析法（clone library profiling） 4
1.2.2遗传指纹图谱技术（genetic fingerprinting） 4
1.2.3分子杂交技术(molecular hybridization techniques) 6
1.3研究思路、技术路线和章节安排 6
1.3.1研究思路 6
1.3.2研究技术路线 7
1.3.3章节安排 7
第2章梅梁湾蓝藻水华暴发过程中浮游细菌群落结构多样性的研究 9
2.1蓝藻水华的暴发对细菌群落结构组成存在潜在影响 9
2.2研究方法 10
2.2.1样品的采集和预处理 10
2.2.2样品的处理 11
2.2.3细菌基因组DNA的提取 11
2.2.4细菌群落结构的T-RFLP分析 12
2.3研究结果 14
2.3.1理化指标的季节变化 14
2.3.2浮游藻类群藩结构组成的季节性变化 18
2.3.3T-RFLP分析浮游细菌群落结构的变化 19
2.3.4多元统计分析 21
2.4讨论 24
2.4.1梅梁湾浮游藻类群落组成的时空差异及其原因 24
2.4.2梅梁湾浮游细菌群落组成的时空差异及其原因 25
2.5小结 26
第3章微囊藻水华堆积、分解过程中湖泊细菌群落结构多样性的实验研究 27
3.1相关研究进展 27
3.2研究方法 28
3.2.1实验设计 28
3.2.2样品的采集和预处理 28
3.2.3理化指标的测定 29
3.2.4细菌计数 29
3.2.5细菌基因组DNA的提取 30
3.2.6细菌群落结构的T-RFLP分析 30
3.2.7克隆建库、测序、系统进化分析、确定T-RFs所属细菌菌群 30
3.2.8统计分析 32
3.3研究结果 32
3.3.1理化指标的变化 32
3.3.2细菌数量的变化 34
3.3.3T-RFLP分析浮游细菌群落结构的变化 34
3.3.4T-RFLP分析附着细菌群落结构的变化 36
3.3.5系统发育分析、确定T-RFs所属细菌菌群 37
3.3.6细菌群落结构变化与环境因子间的相关分析 47
3.4讨论 49
3.4.1水华微囊藻分解过程中细菌数目和群落结构组成的变化 49
3.4.2永华微囊藻分解过程中放线菌成为优势种群 50
3.4.3水华微囊藻堆积、分解过程中军团茵大量出现 51
3.5小结51
第4章微囊藻水华干扰后浮游细菌群落结构的恢复性研究 52
4.1微囊藻水华干扰后浮游细菌群落结构的恢复性研究的重要性 52
4.2研究方法 53
4.2.1实验设计53
4.2.2样品的采集和预处理 53
4.2.3样品的处理54
4.2.4浮游细菌基因组DNA的提取 55
4.2.5浮游细菌群落结构PCR-DGGE分析 55
4.2.6克隆文库的构建、构建系统进化树 56
4.2.7统计分析 56
4.3研究结果 57
4.3.1各围隔中理化环境因子的变化 57
4.3.2PCR-DGGE分析的浮游细菌群落结构变化 59
4.3.316 S rDNA克隆文库分析的浮游细菌群落结构变化 61
4.3.4浮游细菌群落与环境因子的相关分析 67
4.4讨论 68
4.4.1高存量蓝藻水华堆积、分解、消退过程中水体理化环境因子
的变化 69
4.4.2高存量蓝藻水华堆积、分解过程中浮游细菌群落结构的变化 69
4.4.3高存量蓝藻水华消退后浮游细菌群落结构的恢复性分析 70
4.5小结 71
第5章藻源性湖泛发生过程中细菌群落结构组成研究 72
5.1引言72
5.2研究方法 73
5.2.1样点设置和样品采集 73
5.2.2细菌基因组DNA的提取 74
5.2.3细菌群落结构的T-RFLP分析 74
5.2.4克隆文库的构建 74
5.2.5陶性克隆的筛选、测序 75
5.2.6序列分析、构建进化树、确定T-RFs所属细菌茵群 75
5.2.7统计分析 75
5.3研究结果 76
5.3.1藻源性湖泛发生过程中水体理化因子变化 76
5.3.2藻源性湖泛发生过程中细菌群落多样性指数的变化 78
5.3.3T-RFLP分析浮游细菌群落结构的变化 79
5.3.4T-RFLP分析附着细菌群落结构的变化 82
5.3.5系统发育分析、确定T-RFs所属细菌菌群 83
5.4讨论 92
5.4.1太湖藻源性湖泛发生过程中水体理化环境因子的变化 92
5.4.2太湖藻源性湖泛发生过程中水体细菌群落结构组成 93
5.4.3太湖藻源性湖泛发生过程中水体细菌群落结构的空间异质性 94
5.5小结 94
参考文献 96