《中国农业科学院年鉴（2012）》主要内容包括：计划财务管理与条件建设、研究生教育与管理、综合政务管理、党建、反腐败与精神文明建设、人事管理与人才建设、科技兴农、国际合作等。

一、总类
中国农业科学院召开干部大会宣布中央关于院主要领导同志调整的决定
解放思想开拓创新跨越发展
——中国农业科学院2012年工作报告
中国农业科学院关于表彰2012年度研究所评价和机关考核优秀单位的通知

二、科研创新
中国农业科学院2012年科研计划执行情况
中国农业科学院2012年科技成果统计表
中国农业科学院2012年获奖成果
中国农业科学院2012年获奖科技成果简介
中国农业科学院2012年获得的其他形式成果
中国农业科学院2012年科技论文等有关数据统计表
中国农业科学院科技平台目录
建设一流现代院所支撑服务现代农业
——李家洋在中国农业科学院七届二次学术委员会上的讲话
李家洋在院2012年国家自然科学基金重大项目发展工作会上的讲话
刘旭在院2012年国家自然科学基金重大项目发展工作会上的总结讲话
刘旭在农产品质量安全风险评估研究中心建设启动暨质检中心工作研讨会上的讲话

三、科技兴农
中国农业科学院2012年科技兴农工作总结
中国农业科学院科研试验基地目录
中国农业科学院2012年度科技开发调查统计简况
锦州市人民政府与中国农业科学院科技合作协议书
中国农业科学院与修武县人民政府农业科技合作协议书
中国农业科学院与广东省农业厅农业科技合作协议书
江西省人民政府与中国农业科学院合作共建鄱阳湖生态经济区现代农业科技创新示范基地协议书
中国农业科学院与巴彦淖尔市人民政府农业科技合作协议书
镇江市人民政府与中国农业科学院科技合作协议
蚌埠市人民政府与中国农业科学院农业科技战略合作协议
中国农业科学院与安康市人民政府农业科技战略合作协议
中国农业科学院与中国农业电影电视中心合作协议
中国农业科学院与黑龙江垦区国家现代化大农业示范区科技合作协议
中国农业科学院与中粮集团有限公司科技战略合作框架协议

四、国际合作
中国农业科学院2012年国际合作工作概况
中国农业科学院和加拿大农业与农业食品部关于农业科学研究与人才交流合作的谅解备忘录
中国农业科学院与非洲能力建设基金会合作谅解备忘录
中国农业科学院与墨西哥农林牧研究院科技合作协议
中国农业科学院与美国北卡罗莱纳州立大学合作备忘录
中国农业科学院与罗马尼亚美亚集团Coutinho Caro+Co公司合作协议

五、人事管理与人才建设
中国农业科学院2012年人事人才工作综述
中国农业科学院组织机构图
中国农业科学院及院属单位领导人员名单
中国农业科学院2012年院属各单位人员情况统计表
中国农业科学院2012年院属各单位专业技术人员情况统计表
中国农业科学院2001-2012年全院离退休人员变化情况统计表
中国农业科学院2012年院属各单位离退休人员情况统计表
2012年中国农业科学院专家获各种奖项、荣誉称号
中国农业科学院2011年度晋升专业技术职务任职资格人员名单
中国农业科学院公开招聘人员暂行办法
中国农业科学院关于进一步加强博士后工作的意见
中国农业科学院博士后工作管理办法
……
六、计划财务管理与条件建设
七、研究生教育与管理
八、综合政务管理
九、党建、反腐败与精神文明建设
十、人物介绍
十一、大事记
十二、附录