金陵刻经处除藏有自刻经版47000余片外，还保存有支那内学院经版14300余片、扬州砖桥江北刻经处经版22900余片、北京刻经处与天津刻经处经版22800余片，以及北京三时学会、苏州洞庭西山祇树庵、常州天宁寺等处经版，总计达12万5千余片之多。其中，许多经版上刻有供养人的题记，其中不少涉及近现代史上的知名人士，如谭嗣同、欧阳渐、黎元洪、鲁迅等。