东京郊外的宫濑别墅发生了入室抢劫案，歹徒的目标是指明巨额宝藏的密文。大侦探明智小五郎能否抢先破解密文，找到宝藏？歹徒又会有怎么的阴谋诡计？一场扣人心弦的激烈争斗即将展开……

月光照射下的东京银座街头，出现一个青铜模样的特大怪物，只见他身上挂着许多怀表，还不时发出令人毛骨悚然的咬牙声音。怪物走路爬行状，可速度犹如一阵风。自从青铜怪人出现后，被盗案此起彼伏。 明智大侦探与少年侦探团齐心协办，使青铜怪人终于在世人面前真相大白。

天野勇一家附近的鬼屋里，搬来了一个奇怪的魔术师，他宣称自己拥有一个奇幻王国，并邀请孩子们来参观。当勇一上台配合表扬魔术的时候，却莫名其妙地消失了……大侦探明智小五郎带领少年侦探团全体出动，终于发现了魔术师的真面目，救出了天野勇一。

东京城里有透明怪人的话题，被新闻媒体炒得沸沸扬扬。不久岛田的珍珠宝塔被人盗走，接着明智大侦探夫妇相继失踪也变成透明人。一天，透明怪人团伙的首领怪老人被抓，盘问怪老人的审讯室里居然出现三个明智大侦探，这究竟是怎么回事？明智大侦探和少年侦探团能将犯罪嫌疑人绳之以法吗？

被关押在监狱里的怪盗二十面相宣称，自己已经升级为四十面相，并成功越狱。这一回，他的目标是黄金骷髅的宝藏，大侦探明智小五郎和小林芳雄能够抢先破解宝藏的密码，并再次将四十面相绳之以法吗？

日本上空出现了宇宙飞碟，有很多人都亲眼目睹，媒体也竞相报道。飞碟中的怪人，在日本频频亮相，制造一个又一个事件，这使人们陷入恐慌。大侦探明智小五郎和他的徒弟小林芳雄，又一次与歹徒斗智斗勇，揭开宇宙飞碟和宇宙怪人的秘密……

天色暗淡的傍晚，一位白胡子爷爷出现在东京的一条街上。他与少年们交谈时谎称深山老林里有铁塔王国，并要挟高桥贤二的父亲向铁塔王国捐助巨额经费。因其父亲拒绝捐助，贤二遭到绑架。少年侦探小林秘密潜入铁塔王国，被歹徒识破，与贤二一起被关押在空中牢房，情况紧急。明智大侦探与警方能否端掉铁塔王国，抓获独角虫怪物团伙？

东京城里发生了一连串的抢劫盗窃案件，并且事后在案发现场都发现了落款灰色巨人的便笺。在珍珠塔和珍珠项链之后，歹徒将目标对准了少年侦探园井家的彩红宝石王冠，少年侦探团和流浪儿别动队全体出动，能够战胜神秘的灰色巨人吗？灰色巨人的真面目到底是什么呢？

某海难救助公司接受委托，潜入某处浅海区打捞一艘沉船，结果连沉船影子也没有见着。十天后，少年侦探贤吉在神社森林里发现一个匆忙的人影。这人让他保管一只小铁箱，箱子里藏有当年的船长遗书、保险公司的证明书和到航海图。为寻找和打捞这批黄金，潜水员先后在沉船附近发现铁人鱼、鱼形潜水艇和巨型螃蟹等……

东京城里出现了一头专门吞吃珠宝和钞票的黄金豹，它先后抢劫了银行、珠宝店，还引发了一起列车劫案，搞得人心惶惶，而且每次它消失的时候，都会出现一个老人……大侦探明智小五郎和小林芳雄带领少年侦探团层层设防，终于撕下了黄金豹的伪装，让所有的失物物归原主。