本书共分为5章，分别为绪论、原核微生物、真核微生物、地衣和专题报告案例。作为主体的中间三章，是按照野外实习微生物学所涉及主要微生物的不同类群进行分述。这里未涉及病毒和其他非细胞型微生物的原因是实习中需考虑生物安全问题。另外，由于本教材拟和本学院野外实习生物学其他学科进行系列出版，属于微生物的藻类相关内容不在本教材范围内。