本书内容分为两个部分，第一部分收集北京中国第一历史档案馆、台北故宫博物院以及台北“中央研究院”历史语言研究所典藏自康熙六十一年至乾隆四十七年间历任巡台御史的全部奏折约400份左右；第二部分收集与清代巡台御史制度及巡台御史个人有直接关系的上谕和其他大臣的相关奏折作为“附录”。